アドオンのインストール
Blender2.8ではデフォルトの機能で頂点アルファを編集する機能がないため、 アドオンをインストールする必要があります。
アドオンはVertex Color Masterを使用します。
v0.84をクリックしてzipファイルをダウンロードする
ダウンロードしたらBlenderを開いて
編集 → プリファレンス → アドオン → インストールで
ダウンロードしたzipファイルをを選択してファイルからアドオンをインストールを選択してインストールする。
アドオンの有効化
編集 → プリファレンス → アドオンからVertex Color Masterにチェックをいれてアドオンを有効にさせる。
アドオンは頂点ペイントモードで動作します。
頂点ペイントモードにしたら右側にVCMがあるはずなのでそれをを選択すればVertex Color Masterを使用することが出来ます
頂点アルファ編集方法
Active ChannelsのAを選択して、Isotate Active Channelをクリックします。 そうすることでアルファチャンネルの編集画面に移行できます。
下記画像は編集画面です。
ブラシ設定で「F:」の部分の値を変えることで塗るアルファ値の強度を変えれます。
ブラシなどで塗って頂点アルファを編集したら最後にApply Changesをクリックすることで編集した頂点アルファが保存されます。
これを忘れると意味がないので注意しましょう。
おまけ
試しに適当に頂点アルファの調整したものをFBXで書き出してUnityに組み込んでみました。 ちゃんと透明になっていますね。
なおUnityで頂点アルファを反映させるには頂点アルファを使用しているシェーダーを使用しなければなりません。
ShaderGraphで書くとこんな感じになります。
Vertex Colorを使用することで頂点カラーの情報を取得できるのでそれを利用してる感じです。
追記 上手く塗れない場合はブラシの設定を確認してください。 それで無理そうならモデルだけ別のプロジェクトに移して試してみるといいです